എന്നാൽ, ഭോസലെയുടെ നേതൃത്വത്തിൽ 1999ലെ നിയമസഭാ തെരഞ്ഞെടുപ്പിനെ നേരിട്ട കോൺഗ്രസ് 75 സീറ്റ് നേടി വലിയ ഒറ്റക്കക്ഷിയായി. തുടർന്ന് എൻസിപിയുമായി സഖ്യത്തിൽ സർക്കാർ രൂപവത്കരിച്ചു. കോൺഗ്രസ്-എൻസിപി സഖ്യം തുടർച്ചയായ 15 വർഷം മഹാരാഷ്ട്ര ഭരിച്ചു.