തുടര്ന്ന് വിലാപയാത്രയായി അന്തിമഘട്ട ശുശ്രൂഷകള്ക്കായി ഭൗതികശരീരം സെന്റ് തോമസ് കത്തീഡ്രലിലേക്ക് കൊണ്ടുപോയി. കത്തീഡ്രലില് അവസാനഘട്ട വിടവാങ്ങല് ശുശ്രൂഷയ്ക്കുശേഷം സംസ്കാരത്തിനായി ഭൗതികശരീരം ദേവാലയത്തിനു പുറത്തേക്കെടുത്തു.
ബിലീവേഴ്സ് ഈസ്റ്റേണ് ചര്ച്ച് അഡ്മിനിസ്ട്രേറ്റര് സാമുവല് മാര് തിയോഫിലോസ് കാര്മികത്വം വഹിച്ചു. മദ്ബഹായ്ക്കു സമീപം തയാറാക്കിയ പ്രത്യേക കല്ലറയില് കെ.പി. യോഹന്നാന് അന്തിമവിശ്രമവുമായി.